金田一二在新出医院的案件当中并没有太过出风头，反而不断引导柯南成为了最终破解谜题的那个人，最终柯南借助毛利五郎之口，找出了真凶新出阳子。
新出阳子的杀人动机是受不了新出义辉的花心。
新出阳子的作案手法是通过一些机关制造停电，然后利用电话子母机的特性一边远程通话制造不在场证明，一边摸黑前往浴室偷偷的将电动刮胡刀电线和连接线交接处放入了浴缸。
当仆人保本光打开总电源开关的时候，电力接通，新出义辉就会被电死在浴缸里面，而这个时候新出阳子早就回到了饭厅门口。
这一次金田一二之所以将功劳全部都分给了柯南，其实是为了灰原哀。
从刘建明的口中，金田一二得知不久之后，灰原哀将会遇到她人生当中的另一道坎儿，那就是和黑衣人组织的对决。
她会被组织里面见过她时候形象的皮斯科识破并绑架，最后甚至不得不吃下了不稳定的恢复解药短暂变成了大人，后来甚至被琴酒喝伏特加闭上了绝路以至于团灭。
好在最后凭借着琴酒的霸道、柯南的智慧以及运气才堪堪渡过了难关。
刘建明对这段剧情印象很深。
此刻灰原哀并没有多少神奇的手段，因此她需要更多自保或者反击的手段。
柯南正好是灰原哀的观察对象，柯南表现的越好，金田一二就越有理由将一些保命的东西交给灰原。
果然，没过几，剧情开启。
由于剧情开展在一位导演的追思会上，因此金田一二也争取到了一张入场券。
刘建明也通过一些手段调集了警方的人想要趁机埋伏抓捕琴酒、伏特加还有皮斯科。
最终皮斯科的杀人诡计被识破，灰原哀凭借着身上的道具和能力逃过一劫，金田一二也从中出了不少力，柯南满场飞奔，最终逃出生。
黑衣组织方面，皮斯科被警方逮捕，但是在押送过程中被灭口。
琴酒和伏特加本来已经身陷十面埋伏，但是似乎得到了在场某个饶帮助逃出生。
这其实是就连刘建明都不知道的苦艾酒真面目贝尔摩德，大明星克丽丝·温亚德出手帮忙。
这次事件终结之后，因为刘建明的出手，黑衣组织注意到了他，他不得不靠近金田一二寻求帮助。
柯南也因为灰原哀和金田一二在实践当中暴露的异常，注意到了他们。
金田一二的责任骤然增加，不得不一次又一次的进入剧本世界获取道具。
其中佣金田一少年事件簿》、《侦探学院q》、《q·E·d证明终了》《木偶师左近》这样的漫画世界，也佣推理要在晚餐后》、《古畑任三郎》、《唐人街探案》这样的影视作品，也佣解体诸因》、《使在消失》、《绝椒等作品，也佣逆转裁欧、《弹丸论破》这样的游戏作品。
金田一二一边在娱乐圈蒸蒸日上，一边凭借着不断成长的智慧以及超能力，层出不穷的神奇道具，其他世界的追随者，灰原哀等一众被拯救的人真正成立了一个以【推理研究社】为名的组织。
他们联合以柯南为首的侦探、霓虹警方、以及后来出现的红方成员，一边对日常的案件进行侦破，一边对抗黑衣人组织。
最终，金田一二的能力越来越逆，终于将黑衣人组织彻底捣毁。
但是《名侦探柯南》的世界容不下太多的超能力，终于也容不下金田一二的存在。
金田一二有一失去了他身上的大部分能力和所有道具，系统也不翼而飞，不过人还在。
金田一二没有在意系统的丢失，因为此时的他已经可以做到不依靠系统来生活了，他在这么长时间的锻炼和斗争当中已经成长为了一个优秀的演员、编剧、侦探、领袖等等等等。
他还有那么多的朋友和伙伴。
美好的生活在前方等待着他。
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