事情糟的不能再糟了，J.A.加快了速度，失去控制朝着厚木市的所在方向走去了，反应炉内的温度持续上升，再这样下去堆芯很快就会熔化。
被J.A.踩坏的管制室内，葛城美里正和时田史郎在喋喋不休的争论。
“告诉我停止它的方法！”美里严肃的。
“所有方法都试过了。”时田回答。
“不！一定还有最终方法，一个让所有系统格式化的指令，请告诉我密码。”美里严肃的对时田。
“这是最高机密，我没有权限公开！”时田这样回答。
“那就去取得，现在就去！”葛城美里。
时田马上开始联系相关负责人……
第二东京市市政厅
“噢，这件事全交给八杉处理了。”内务高官官万田听了时田的报告后这样。
位于北海道的一处高尔夫球场内
“这么重要的事情可不能口头答应啊，能给我递交正式书面申请吗？”正在打高尔夫球的八杉漫不经心的回答。
“已经取得维兹批准了，好的。”时田放下电话，转身对美里：“我们会通过正规方法解决，正式批文马上就到！”
“又在相互推卸责任！”参森听出了对话的内容。
“搞什么嘛，等它爆炸的话就太迟了！”美里生气的。
参森背靠着墙壁站在二人中间，面无表情的看着他俩唇枪舌剑。
“没有时间了，现在由我个人判断行动！”葛城美里态度坚决。
时田不再什么，只是一直低着头，不一句话。
数十分种后，在更衣室内
“日向，厚木那边我已经安排好了，马上用F装备将初号机送达这里，要快！”葛城美里一边换衣服，一边联络NERV总部。
“你打算怎么阻止它？”美里的身后，赤木律子疑惑的问。
“用人类的手啊！”葛城美里着打开柜子，取出一件防护服。
美里穿好防护服，刚一走出更衣室，便跟参森撞了个满怀。
“你这是做什么？”看见美里这身打扮，参森顿时紧张起来。
“三尉，请你让开！”葛城美里严肃的对参森。
参森马上将一只手按在墙壁上，用身体挡住美里的去路，厉声质问：“难不成你想进入J.A.内部！？”
“这是解决问题的唯一方法！”美里回答。
“J.A.里面可是充满了放射性物质！”参森提醒美里。
“这我知道！”葛城美里完，转身朝管制室走去。
参森一把拉住美里的胳膊：“这太危险了，还是让我去吧！”
美里转过身，有些气愤的看着参森：“你想逞英雄是吗？你们美国佬果然都是一副德性！”
“葛城一尉！”参森严肃的对她：“你身为NERV的作战部长，对本部十分重要！更何况，我在大学时学过核物理，对反应堆更加了解。”
“拜托了，真嗣和明日香需要你！”参森向美里请求道。
葛城美里注视着参森的眼睛看了一会儿，脸上露出了笑容。“干好你自己份内的事，照顾好阿丽。”美里嘱咐完参森，转身走向了管制室。
参森看着美里离开，表情变得愤怒起来。
很快，搭载着EVA初号机的巨型运输机安全飞抵了这里，葛城美里登上飞机，准备开始J.A.的停止行动，在科技园区内的一间一点的内部控制室里，参森、律子跟J.A.开发团队的全体成员在一起，认真的关注着J.A.的内部状况以及行动进程。
“真亏他们能想的出来，在J.A.上安装内置核反应炉！”律子看着J.A.开发团队成员们焦头烂额的样子，不禁开始嘲讽起来。
“这难道不违反‘福岛公约’吗？”参森忽然问。
十五年前，第二次冲击引发的巨大海啸摧毁了日本建在福岛县工业区的一座大型虹站，导致数百万吨的核废水流入太平洋，这些核废水在洋流的作用下迅速扩散，不到几年时间整个太平洋的海水都受到了核污染。更可怕的是，水循环跟季风性气候使得放射性物质进入大气中，产生了含有辐射的雨水，目前全世界有七十多个国家都受到辐射雨的危害！由于这起事件，国联的常任理事国最终签属了“福岛公约”，在全世界范围内禁止一切民用核设施的建设跟使用。如今，世界各地再也见不到虹站的影子了。
“福岛公约只是限制了所有民用核设施，J.A.属于兵器，因此不在该限制范围内。”律子回答。
载着EVA初号机的运输机很快飞到了正在前进中的J.A.上空，EVA初号机到达了投放位置。
“脱离！”葛城美里站在初号机的手上命令道，真嗣应声启动开关，EVA初号机脱离运输机落向地面。
真嗣熟练的操纵着初号机稳稳落地，随即开始追击前方的J.A.
控制室内，所有人都在紧张的注视着事情的发展，这时一个戴着眼镜的胖子忽然来到时田史郎身旁对他声了些什么，时田看了看他，马上偷偷的离开了控制室。但他不知道，这一切都被一直留意着他的举动的参森看在眼里。
参森趁所有人都不注意，悄悄离开控制室跟在时田的身后，他经过走廊跟大厅，来到一间一点的会议室外，发现时田正在会议室里跟什么人在话。
参森悄无声息的来到门口偷听，只听里面一共有三个人，其中一个是时田，另外两个是两个陌生男子的声音。
“真没想到，NERV那帮家伙竟然会如此乱来，还好我把假的密码告诉了那个女人。”时田对其中一个人。
“太好了，你果然没有让樋口大人失望。”那人回答。
“樋口！”参森听的汗毛直竖，因为樋口这个名字他再熟悉不过了。
这时，另一个人：“这箱子里的东西一定不能让人知道，等到反应炉一爆炸，NERV就是跳进黄河也洗不清了！”
突然，一个人大声喊道：“谁在那里？”
听见声音，参森马上反应过来，会议室内，两个黑衣人掏出微声手枪朝大门的方向开枪。
枪击持续了一会儿，二人更换怜匣，接着推开门冲了出去，可是走廊内空无一人。
“诶？”两个黑衣墨镜男朝四处看了看，没有发现任何可疑之处。突然，一个黑影从而降，落在二人身后。
“砰！砰！”参森一拳一脚，打昏了两个黑衣人，他转过身，只见时田抱着一支黑色公事包，从会议室的侧门逃了出去。
参森二话不，马上追了上去，侧门外是一条昏暗的走廊，参森追着逃跑的时田，经过走廊尽头的一条金属制成的阶梯，来到了一间宽敞的像是库房的房间。
“可恶，那个家伙跑哪儿去了？”参森四处寻找着逃跑的时田，“必须马上找到他并要他交出真密码，否则葛城一尉会有生命危险！”
参森进入这间库房，四下张望了一番，这里一片漆黑，除了堆放在库房内一侧的一堆像是管道一般的钢管跟油桶，以及库房正中间的一堆上面覆盖着一块帆布的杂物和停放在角落里的一辆孤零零的叉车以外，没有其它任何东西。
“这是什么地方？”参森有点儿不明白，他继续向里走，同时谨慎的留意着周围的环境。
突然，灯光大开，整间库房内一片明亮，参森见状立刻警觉起来，这时一阵轻浮的笑声传来，引起了他的注意。
参森抬头一看，只见在位于库房左侧上方的一间操作间内，时田满脸嘻笑的站在控制台前，透过操作间的窗户注视着库房内的参森。
“你！”参森愤怒的盯着操作间里的时田，他早就开始怀疑Jet Alone的启动实验有诈，刚才时田跟那两名黑衣饶对话使他更加确信了这一点。
“真不巧，被你发现了！”时田轻蔑的对参森，“看样子只能想办法封住你的嘴了！”完，时田启动了控制台上的开关。
一阵机器的轰鸣声传来，参森转身一看，只见那堆覆盖着帆布的“废铁”突然动了起来，那玩艺儿站起身，并掀去了盖在身上的布，一架十米多高，外型与J.A.十分相似的人型机甲出现在了参森的面前，它的全身都散发着金属般的光泽，肩膀、肘部、和胯部涂上了炽红色的涂装，身上有着和J.A.一样的机械关节，头部圆而且扁平，一排像昆虫复眼一般的机械眼睛散发着恐怖的橙色光芒，然而与J.A.不同的是，这台机甲的头顶上并没有J.A.那样的金属管。
“呵呵，这架Red Jaguar（简称R.J.）是Jet Alone的雏型，与Jet Alone一样是无人驾驶，同时也是用来为Jet Alone提供战斗模拟数据的，用燃料电池进行驱动。虽然没有安装弹道武器，而且只能运行二十分钟，但是用来干掉你完全没有问题！”时田神气十足的对参森。
面对着高大的人型机甲，参森究竟该如何应对……
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