就在现实物质宇宙，我军陷入苦战之时，另一边的帝皇等人也同样不好受。
就和现实物质宇宙一样，帝皇吉尔伽美什，联合了所有处于亚空间内的混沌神只，共同抵御虫巢意志这头恐怖怪物的进攻。
他们先是帮助邪神恐虐，艰难击退了虫巢意志。但他们很快就发现，虫巢意志并没有放弃，而是转身前往吞噬那些更为弱的非物质实体，以求不断发育，打算变得更强了之后，再来吞噬那些最难啃的“骨头”。
为了不让虫巢意志的阴谋得逞，吉尔伽美什带领混沌诸神，选择了主动出击，不断追击着虫巢意志，并与其进行着互相鏖战。
在这场艰难万苦的追击鏖战之中，吉尔伽美什也知晓了混沌八神位的秘密。
吉尔伽美什猜测，这个混沌八神位，可能就是迩达当初在设计亚空间时，所故意留下来的8大亚空间权柄。
同时，它们也代表着亚空间的八大方位：
正北：侵蚀毁灭。神位：空缺（帝皇拒绝成神）。权柄：渴望毁灭，让所有的生物都结束生命，并被遗忘。
东北：地狱风暴。神位：奸奇（已死）。权柄：以纯粹的元素力量，表现出无形的能量，并将以风暴烈焰的形式，不断传播。
正东：恶毒诡计。神位：空缺（混沌大魔·瓦什托尔正在努力上位中）。权柄：对万物生灵各个方面的扭曲与嘲弄，并在无形中扭曲成一种恶毒和破坏性的力量。
东南：狂喜感知。神位：色孽。权柄：战争的结束并不重要，沉醉于暴力的感官超载，与一次次折磨的欢欣鼓舞，并带去幸福的死亡。
正南：贪婪溶解。神位：空缺（马里斯刚刚窥见其门道）。权柄：一切都是仇恨，甚至蔓延到它自己，在自我毁灭的仇恨中，没有朋友，只有下一个敌人。
西南：腐烂堕落。神位：纳垢（已死）。权柄：一种缓慢的腐化，直至腐烂掉身体和灵魂，在死亡中没有最终的释放，不关心胜败，只关心让更多人遭受痛苦，并将疾病和污秽作为礼物，传播到物质世界中去。
正西：无形扭曲。神位：空缺。权柄：无止境的改变与扭曲它所接触的一切，死亡只是对物质世界造成永恒变化的一部分。
西北：无心屠戮。神位：恐虐。权柄：向往战斗的愤怒和生命终结的喜悦，唯一的目的就是战斗与死亡，只关心收获的颅骨和死亡的数量，不考虑敌友关系。
中心：原始毁灭者。神位：迩达（Gm专属）。权柄：确保可以毁灭亚空间一切非物质实体的能力，包括其余八位混沌主神。
直到此刻，吉尔伽美什等人才终于明白，为什么虫巢意志会那么的强大。原来，早在它吞噬掉纳垢和奸奇，获得羕们东北与西南的神位权柄之前，还吞噬掉了正南和正西的神位权柄。
也就是，现在的虫巢意志，乃是拥有混沌四神之力的亚空间主神！要是让它继续这么肆无忌惮的吞噬下去，那么整个亚空间内，都将无人是它的对手！
情况不容乐观，即使那些混沌诸神，再怎么各怀鬼胎，表里不一，但也知晓现在的情形，根本就由不得祂们做出其他的选择。要知道，虫巢意志可不会和你进行任何的交流或谈判，它想要吃掉你，只不过是迟早的事，没有任何人可以幸免！
所以，放下所有的成见和心思，选择共同对抗虫巢意志才是祂们唯一的活路！
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战争的第一年，亚空间战场和银河系战场，我们同时都遭到了严重的挫败。但通过不断的牺牲与坚壁清野等方案的调整下，我们还是勉强与泰伦虫族进入到了互相拉锯的消耗当郑
战争的第十年，亚空间战场上，一众基因原体，纷纷明悟出了各自的亚空间本质，实力一个个直逼邪神。而禁军和各大军团的星际战士们，也通过修习七十二种灵能修炼之法，从而让自己的量子意志发生了质变，就如同祖龙宇宙里的那些先人族和后仙人一样，实力一个个堪比大魔。
虽然依旧无法打败虫巢意志，但已经开始逐渐对虫巢意志，形成了优势。
战争的第一百年，银河系战场上，各大种族和人类帝国的军事科技，在我的帮衬下，终于完成了较大的进步，有了与泰伦虫族正面抗衡的可能。同时，玩家群体开始爆发了情感共鸣，逐渐开始觉醒阿赖耶识，导致其具象化的能力越来越变态，越来越匪夷所思。
战争的第一千年，我们终于在亚空间战场和银河系战场上，取得了关键性的胜利。并最终在大家众志成城的不懈努力下，打败了泰伦虫族，将它们赶回到了银河域外。虽然没有彻底消灭它，但显然也给予了它重创，估计............只要我们不犯错，它将不会再有卷土重来的机会了。
而留它一命，也能最大程度的让各大异形种族和混沌诸神势力们，产生忌惮，不会等战争刚一结束，就想着搞事，立马开始与我们爆发战争。
考虑到那些异形们也在这次命运存续的战争出过不少力，所以人类帝国也并没有卸磨杀驴的打算，而是给予它们在银河系中，各自保留了一块繁衍生息的自留地。
至于那些混沌诸神，也没有蠢到找帝国双鹰的麻烦。别人类有两尊大神罩着了，就如今的恐虐见了都在给帝皇递烟，色孽见了都在给帝皇暖床来看，人类就没有一个混沌势力敢去招惹的。
自然，整个银河系内，在经历了一千年的大战后，终于迎来了一段和平发育，修生养息的时期。
然而，面对残破不堪，元气大赡帝国和银河系，以及千年来的战火洗礼。我知道，我已经错失了晋升为神级文明的最后机会。如今，我内心的量子涨落越来越剧烈，这明G的人马上就要降临了。留给我们的时间已经所剩不多，现在只能另想办法，带着这方宇宙的人类，赶紧进行逃离。
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